Oral Presentation - 42
Investigation of Gene TRPM6 Mutation in Patients with Neural Tube Defect
M Saraç*, EE Önalan**, Ü Bakal*, T Tartar*, A Tektemur**, E Taşkın***, FS Erol****, A Kazez*
*Firat University, Faculty of Medicine, Department of Pediatric Surgery, Elazig, Turkey
**Firat University Medical Faculty Dept. of Pediatric Surgery
***Firat University Medical Faculty Dept. of Pediatrics and Neonatology
****Firat University Medical Faculty Dept. of Neurosurgery
Objective: There are a number of studies about
polymorphisms that could be involved in neural tube defect (NTD) pathogenesis
of genetic mutations in certain genes that are effective in the process of
closure of the neural tube. It is believed that Magnesium is an element which
plays an important role in bone development, and genes involved in magnesium
homeostasis also lead to NTD etiopathogenesis. In this study the evaluation of TRPM6
polymorphism genotype and allele frequency in NTD patients has been aimed.
Methods: 150 patients admitted a
University Hospital, Paediatric Surgery Clinic diagnosed with NTD as patients
and the control group subjects were included in the study and 150 children
having nearly the same age and sex. From the DNA of the patients polymorphisms
of TRPM6 gene rs2274924 (AG; K1579 to; leu1579gl) and Rs3750425 (GA val1393ıl
A), were studied using taqman prob 7500 Fast Real-Time System (applied Biosystems,
Foster City, CA) and serum magnesium and calcium values of control group and patients
were studied.
Results: It
is determined that there is a statistically significant difference of rs2274924 in TRPM6 gene in terms of genotype
distributions between patients and controls (p = 0.049) and in patients AA
genotype was seen on decrease, yet, heterozygous AG genotype was on the
increase. No significant differences in gene Rs3750425 polymorphism genotype in
TRPM6 allele distributions were seen when control group was compared to patients.
However, in terms of mean serum magnesium levels in the patient group there
were significantly differences. It was
determined that for rs3750425 polymorphism, when compared to GG genotype, the
serum magnesium levels were statistically significantly higher in genotype
polymorphism GA and AA genotype (p = 0.003).
Conclusion: Magnesium deficiency is known to cause intra-uterine growth
retardation, malformation and sudden death syndrome. In NTD pathogenesis
especially in embryonic development, genetic variants of TRPM6 genes in the
regulation of magnesium are believed to play an important role.
Nöral Tüp Defektli Hastalarda TRPM6 Genindeki Mutasyonların Araştırılması
M Saraç*, EE Önalan**, Ü Bakal*, T Tartar*, A Tektemur**, E Taşkın***, FS Erol****, A Kazez*
*Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Cerrahisi AD, Elazığ
**Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji AD
***Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Sağ. Hast. Yenidoğan Bilim Dalı
****Fırat Üniversitesi Tıp Fakültesi Beyin ve Sinir Cerrahisi AD
Amaç: Nöral
tüp defekti (NTD)’nin genetik etiyopatogenezinde nöral tüpün kapanma sürecinde
etkili olan bazı genlerdeki mutasyon veya polimorfizmlerinde rol alabileceğine
dair çalışmalar mevcuttur. Magnezyum kemik gelişiminde önemli rol oynayan bir
element olup magnezyum homeostazisinde rol alan genlerin NTD etyopatogeneinde
rol alabileceği düşünülmektedir. Çalışmada
NTD hastalarında TRPM6 polimorfizm genotip ve allel sıklıklarının değerlendirilmesi
amaçlanmıştır.
Metot: Bir Üniversite Hastanesi Çocuk Cerrahisi kliniğine başvuran NTD tanılı 150 hasta ve kontrol grubu olarak yaş ve cinsiyet açısından
benzer 150 çocuk çalışmaya dahil edildi.
Hasta
DNA’larından TRPM6 genine ait rs2274924 (A˃G; K1579E;Leu1579Glu) ve
Rs3750425 (G˃A Val1393Ile) polimorfizmleri, TaqMan probları kullanılarak ABI 7500 Fast Real Time System (Applied Biosystems,
Foster City, CA) cihazında çalışıldı. Hastaların ve kontrol grubunun serum
magnezyum ve kalsiyum değerleri ölçüldü.
Bulgular: TRPM6 genindeki rs2274924 genotip
dağılımları açısından hasta ve kontrol grubu arasında istatistiki olarak
anlamlı farlılık olduğu (p=0,049) ve hasta
grubunda AA genotipinin azaldığı heterozigot AG genotipinin ise attığı belirlendi. TRPM6
genindeki Rs3750425 polimorfizm genotip ve allel dağılımları açısından kontrol
ve hasta gurbu karşılaştırıldığında anlamlı bir farklılık bulunmadı. Ancak hasta grubunda ortalama serum magnezyum
düzeyleri açısından rs3750425 polimorfizim
genotiplerine göre anlamlı farklılık bulundu. rs3750425 polimorfizmi için GG
genotipine kıyasla GA ve AA genotipinde serum magnezyum düzeylerinin
istatistiki olarak anlamlı düzeyde daha yüksek olduğu belirlendi (p=0.003).
Sonuç:
Magnezyum eksikliğinin intrauterine gelişme geriliği, malformasyon ve ani ölüm
sendromlarına neden olduğu bilinmektedir. NTD etyopatogenezinde özellikle
embriyonik gelişim sürecinde magnezyum düzenlenmesinde rol oynayan TRPM6
genindeki genetik varyantların rol alabileceği düşünülmektedir.